G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
2 | 1 | ||||||||||||||||||||||
G | C | A | G | A | G | A | G | ||||||||||||||||
G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
1 | - | ||||||||||||||||||||||
G | C | A | G | A | G | A | G | ||||||||||||||||
G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | ||||||||||||||||
G | C | A | G | A | G | A | G |
Shift by: 8
G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
1 |
Shift by: 8
G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
2 | 1 | ||||||||||||||||||||||
G | C | A | G | A | G | A | G |
The KMP Skip Search algorithm performs 14 character comparisons on the example.