| G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
| 1 | |||||||||||||||||||||||
| G | C | A | G | A | G | A | G | ||||||||||||||||
Shift by: 5 (ztBc[C][A])
| G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
| 8 | 7 | 6 | 5 | 4 | 3 | 2 | 1 | ||||||||||||||||
| G | C | A | G | A | G | A | G | ||||||||||||||||
Shift by: 7 (bmGs[0])
| G | C | A | T | C | G | C | A | G | A | G | A | G | T | A | T | A | C | A | G | T | A | C | G |
| 3 | 2 | 1 | |||||||||||||||||||||
| G | C | A | G | A | G | A | G | ||||||||||||||||
Shift by: 7 (bmGs[6])
The Zhu-Takaoka algorithm performs 12 character comparisons on the example.